電影: Keiko Imamura

沖繩的安豆味王族有個古老傳說：「當天空浮現黑色的山，將有怪獸毀滅世界，但當紅色的月亮浮出，太陽從西邊升起時，將出現兩隻怪獸拯救世界。」真哥吉拉的現身拆穿了於富士山上肆虐的假哥吉拉。假哥吉拉竟是外星人藏匿於沖繩地底、以宇宙鈦金屬製造的機械哥吉拉。眾人若要拯救世界，必須喚醒沈睡中的沖繩西薩王，與哥吉拉並肩作戰！...

打敗機械哥吉拉之後，哥吉拉帶著嬰兒哥吉拉來到位在南太平洋的巴斯島上，並且將這塊孤立的土地當做牠們的家。一年後，一顆奇怪的隕石從天空掉在島上，觸發了一連串不尋常的事。從隕石裡長出的神秘水晶形成火山口狀，無數謎樣的水晶體隨著一種奇異的能量開合。 Ｇ對策中心為了打敗哥吉拉，同時進行了兩個計畫，分別是製造打敗哥吉拉的新型戰鬥兵器「機械土龍」(M.O.G.E.R.A.)為主的「Ｍ計畫」，與透過精神控制操控哥吉拉的行動的「Ｔ計畫」，對於「擊潰哥吉拉」這件事抱持著強烈信念的Ｇ部隊隊員結城，打著以小哥吉拉為誘餌...

第八號颱風侵襲日本後，倉田濱的工業化計劃區整個垮倒，在靜之浦海灘出現不明巨蛋的消息，正當每朝報社記者酒井和純子前去採訪時，這顆巨蛋已被快樂集團的熊山買下，想藉由建造快樂樂園圖利，巨蛋的守護人要求人類盡速歸還，原來這顆巨蛋為摩斯拉所產下，否則會帶來更多的麻煩，但熊山仍不為所動，守護人對人類失去信任而回到伊房島，此時倉田濱突然出現哥吉拉從地底下爬出，對整個日本......

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